單細胞測序技術(shù)服務(wù)

單細胞測序技術(shù)服務(wù)

一、核心價值：從 “群體模糊" 到 “個體精準"

傳統(tǒng) Bulk 測序：把組織中所有細胞混在一起，只能得到基因表達 “平均值"，掩蓋細胞差異（如腫瘤中少量耐藥細胞、組織中稀有干細胞）。

單細胞測序：分離單個細胞，獨立標記、建庫、測序，精準解析每個細胞的分子特征，揭示細胞亞型、發(fā)育軌跡、微環(huán)境互作等。

二、單細胞測序技術(shù)服務(wù)主流技術(shù)類型（按檢測對象）

scRNA-seq（單細胞轉(zhuǎn)錄組）：測 mRNA，分析基因表達譜，用于細胞分群、差異基因、發(fā)育軌跡、細胞通訊。

snRNA-seq（單細胞核轉(zhuǎn)錄組）：提細胞核 RNA，適配凍存 / FFPE / 難解離組織（如神經(jīng)、纖維化組織），避免完整細胞解離損傷。

scATAC-seq（單細胞染色質(zhì)可及性）：測開放染色質(zhì)，研究基因表達調(diào)控（順式作用元件、轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合）。

scWGS/scWES（單細胞全基因組 / 外顯子）：測 DNA，找單細胞水平突變、CNV，用于腫瘤異質(zhì)性、胚胎發(fā)育、嵌合體研究。

多組學聯(lián)合：如 scRNA+scATAC、scRNA + 蛋白，多維解析細胞狀態(tài)。

三、實驗流程（以 10X Genomics scRNA-seq 為例）

1.      樣本制備：組織酶解 / 機械解離→單細胞懸液→質(zhì)控（活性 > 80%，無團聚）。

2.      細胞捕獲與標記：微流控將單個細胞 + 帶條形碼（Cell Barcode+UMI）的微珠包裹進油包水液滴；每個細胞獲唯yi Cell Barcode，每條 RNA 獲唯yi UMI（防擴增偏差）。

3.      裂解與逆轉(zhuǎn)錄：液滴內(nèi)裂解細胞→mRNA 釋放→逆轉(zhuǎn)錄為 cDNA（帶 Barcode/UMI）。

4.      文庫構(gòu)建：cDNA 擴增→片段化→加測序接頭→建庫。

5.      高通量測序：Illumina 平臺測序，讀長含 Barcode、UMI、基因序列。

6.      數(shù)據(jù)分析：

質(zhì)控：過濾低質(zhì)量細胞 / 基因。

降維聚類：PCA→t-SNE/UMAP→細胞分群。

注釋：Marker 基因匹配已知細胞類型。

高級分析：差異基因、GO/KEGG 富集、發(fā)育軌跡（Monocle）、細胞通訊（CellPhoneDB）。

四、應用場景

腫瘤研究：解析腫瘤異質(zhì)性，找耐藥 / 轉(zhuǎn)移亞群、腫瘤干細胞；分析免疫微環(huán)境（TME），指導免疫治療。

發(fā)育生物學：繪制胚胎 / 器官發(fā)育細胞譜系圖譜，追蹤分化軌跡，揭示關(guān)鍵調(diào)控基因。

神經(jīng)科學：解析神經(jīng)元亞型、腦區(qū)細胞異質(zhì)性，研究神經(jīng)退行性疾病（如阿爾茨海默病）機制。

免疫學：刻畫免疫細胞（T/B/ 巨噬細胞）亞群、活化狀態(tài)、受體多樣性，研究感染 / 自身免疫病。